Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
STAMBPL1Q96FJ0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms