Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms