Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms