Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms