Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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