Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms