Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP7

PCSK9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK9Q8NBP7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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