Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms