Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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