Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HACE1Q8IYU2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms