Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
WDR53Q7Z5U6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms