Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC4Q6P4E1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC4Q6P4E1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms