Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3CQ6NXT2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3CQ6NXT2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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