Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms