Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms