Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYT16Q17RD7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYT16Q17RD7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms