Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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