Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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