Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OCLNQ16625 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OCLNQ16625 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms