Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms