Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms