Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COL19A1Q14993 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms