Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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