Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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