Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2H3Q13889 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms