Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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