Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CUL4AQ13619 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CUL4AQ13619 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CUL4AQ13619 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CUL4AQ13619 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CUL4AQ13619 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CUL4AQ13619 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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