Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms