Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXD4Q12950 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXD4Q12950 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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