Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms