Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
EP300Q09472 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms