Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms