Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC42EP1Q00587 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms