Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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H3F3AP84243 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H3F3AP84243 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H3F3AP84243 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3AP84243 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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