Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX3P78415 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX3P78415 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms