Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms