Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1P60507 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms