Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPFP49454 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms