Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMAN1P49257 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms