Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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