Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGIRP43119 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms