Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNA1P35221 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms