Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms