Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms