Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms