Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NTF3P20783 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NTF3P20783 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms