Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP4AP20648 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms