Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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