Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
TOP2AP11388 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP2AP11388 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms