Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLA1P09884 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLA1P09884 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLA1P09884 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLA1P09884 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms